El trabajo de tesis o proyecto terminal (equivalente a tesis), es deseable que nazca a partir de la detección de un problema o situación susceptible de mejora en la Estancia Laboral a realizarse en el tercer semestre, y con la guía de su tutor en el curso Seminario de investigación aplicada I, que puede ser o no el reporte final de su estancia.

En el cuarto semestre, en el curso de Seminario de investigación aplicada II, se espera que cada estudiante concluya su proyecto terminal que deberá ser aprobado por su director y co-director, nombrados por el Comité Académico, independientemente de la modalidad del trabajo, para su posterior defensa.