La Secretaría Administrativa surge durante el período rectoral 2013-2017, a cargo del Dr. José Antonio Ruz Hernández, como un Órgano de Administración e Instancia de la Administración Central de la Universidad, que colabora con la Rectoría en la coordinación e integración de las funciones adjetivas de la institución, mediante el apoyo, en la gestión de trámites administrativos, a las diversas dependencias, entidades académicas y/o centros de investigación.