Las funciones de la Secretaría General son:

1. Atender en todo lo relacionado con el funcionamiento del Honorable Consejo Universitario, sus asambleas y la socialización y tramitación de las resoluciones y normativas de este órgano de gobierno.
2. Coordinar y/o asistir a las comisiones internas del Honorable Consejo Universitario.
3. Coordinar con las áreas operativas y académicas de la institución, en todo lo relativo a la tramitación, identificación, manejo y archivo de la documentación que ingrese a la Universidad.
4. Asesorar al Rector a través del desarrollo de proyectos que tiendan al mejoramiento de las funciones sustantivas y adjetivas de la institución.
5. Dictar las providencias a las áreas de los trámites ordenados, pases o reservas de expedientes, notificaciones, visitas, desglose y entrega de documentos y archivo final de actuaciones.
6. Intervenir y supervisar al área encargada sobre la administración central del personal de la Universidad.
7. Injerirse en la resolución, ejecución y difusión de todos los asuntos relativos a los intereses jurídicos de la Universidad.
8. Coordinar el proceso de selección, formación, calificación, análisis y evaluación del personal no docente de la Universidad.
9. Coordinar los asuntos que propicien el funcionamiento general de la Universidad que por delegación rectoral le sean encargados.
10. Coordinar y/o asesorar en el diseño de estructuras, sistemas y procedimientos administrativos acordes a las necesidades de los distintos sectores y dictaminar sobre las modificaciones de organización y procedimientos que de ello resulte.
11. Refrendar las resoluciones y ordenanzas relacionadas a su área de competencia.
12. Tramitar la correspondencia oficial.
13. Firmar por sí, sólo los documentos de mero trámite; caso cheques cuyo monto no excedan los cien mil pesos, salvo excepcionalmente cuando el Rector lo autorice.
14. Coordinar la redacción del Informe Anual de la Universidad conforme a las instrucciones del Rector y de acuerdo con los informes de las escuelas, facultades, dependencias, coordinaciones y unidades administrativas universitarias.
15. Coordinar de forma quincenal el avance de las acciones, objetivos, metas o compromisos de las áreas de mando medios y superiores de la administración de la universidad y la evolución de las áreas académicas y de investigación.